一个年轻修女在罗马尼亚与世隔绝的修道院自杀，梵蒂冈派去一名神父和一名快结束见习期的修女展开调查，而神父有令人毛骨悚然的过去。他们一起揭开了教会邪恶的秘密，不仅冒着生命危险，还拿信仰和灵魂当赌注，面临着一股恶毒的力量，恶魔修女再次成为强大的威胁。

《修女》改编自法国著名作家和哲学家狄德罗的小说代表作，以夸张的手法揭露宗教禁欲主义的虚伪和修道院阴森可怖的内幕。 影片描述了一个年轻的修女，为了不愿意当修女，为了逃避当修女的命运，所作的种种艰苦的斗争，以及因此而遭受到的种种迫害和苦难。苏珊修女，因为是私生女，从小得不到父母的宠爱。十六岁那年，被哄被骗，加上被逼，被送进了修道院，被穿上了修女的制服。到了十八岁，她必须公开宣誓当修女。她性格坚强，在任何场合，她都不肯宣誓当修女。这下可恼怒了教会，于是，她的院长嬷嬷，她的神师，以至于她周围的修女，都以最大的迫害和愤怒来惩治她。通过对于这些惩治的描写，教会的专制主义，教会的愚昧和黑暗，都被揭露无遗。

秀女（谢兰 饰）被土匪抢到西部小镇打算送给镇长（王自中饰）做妾，她趁夜色逃脱后被一牧民收留。歹人汤三（王戎 饰）贪恋秀女美色，奉上彩礼择日迎娶。收留她的表姐夫（李心敏 饰）不甘肥肉落入他人之口，娶亲前夜强暴了秀女。迎娶之日与镇长发生冲突，经比武后汤三如愿娶秀女回家。当夜发现秀女不是处女，气势汹汹到表姐家讨说法。从此秀女生活在汤三淫威下，出生的孩子被汤三在睡梦中压死。表姐夫出于内疚上门看望秀女，被早就心生嫉恨的汤三开枪打死。表姐（董娉 饰）找汤三算帐，不料被镇长的手下轮奸，精神完全崩溃了。在野外田间，秀女险遭歹人侮辱，被一过路先生（邓炜霖 饰）相救，这位先生是竟当局通缉的要犯……